Tom和Diana發(fā)現(xiàn)，原來NTAC就是這次瘟疫事件的幕后策劃者，他們發(fā)現(xiàn)了政府掩蓋事實(shí)的陰謀。NTAC并不是有意而為，只是為了阻止4400的超能力的影響擴(kuò)大而秘密使用了抗化劑，但是副作用卻引起了瘟疫。但是他們并沒有想辦法為4400生病的人治病，而是把精力放在了如何掩蓋事實(shí)真相上。Tom和Diana開始潛入自己的機(jī)構(gòu)內(nèi)部，揭開隱藏的事實(shí)，并且試圖及時(shí)找到治療瘟疫的方法。